Enrichment analysis

富集分析原理

对于基因集功能富集分析原理之前一直不怎么清楚,虽然已经可以做出 GO/KEGG 富集分析,但原理还没有去学习过,这显然是不行的。参考了许多老师的文章,写一下自己对于富集分析原理的理解。

对人类基因进行 GO 富集分析

最近有一位师兄找我帮忙写一些 R 语言代码,实际上我也不怎么会,网上「借鉴」一些,自己改一些,达到目的似乎也就可以了。但是日后可能要经常和 R 语言打交道,所以还是研究清楚一些比较好。本文说说对人类基因进行注释并做 GO 富集分析。

GO&KEGG 富集分析

功能富集分析是将基因或者蛋白列表分成多个部分,即将一堆基因进行分类,而这里的分类标准往往是按照基因的功能来限定的。换句话说,就是把一个基因列表中,具有相似功能的基因放到一起,并和生物学表型关联起来。