R

Ubuntu 安装 R 包的时候总会有一堆的错误，无非就是缺少一些库，使得 R 包或者 R 包依赖的 R 包安装不上，补上库和 R 包就可以了。

今天要做一个差异表达分析，理所当然的用上 Deseq2 包。

今天在 Debian 上安装 Seurat 报错，说是缺少依赖的 R 包，但是安装依赖的两个 R 包又报错。

Debian 默认自带的 R 版本太低了，所以需要自己编译安装最新版的 R。

还是之前拿到的转录组数据，只有表达量矩阵是不行的，作为 RNA-seq 下游分析重要的一步，差异表达分析将不同处理下的基因表达数据同对照组做统计分析，筛选出具有显著表达变化的基因集，这一步对后面的研究是很有必要的。

今天使用 R 绘制热图，由于我的 R 是在 Debian 下的，默认是没有新罗马字体的，而我们平时作图的时候喜欢用新罗马字体，于是就需要自己安装然后使用。

最近有一位师兄找我帮忙写一些 R 语言代码，实际上我也不怎么会，网上「借鉴」一些，自己改一些，达到目的似乎也就可以了。但是日后可能要经常和 R 语言打交道，所以还是研究清楚一些比较好。本文说说对人类基因进行注释并做 GO 富集分析。