个人信息
- 焦元 / 2003
- 教育经历:成都理工大学 / 环境科学与工程 / 2021 级本科 / CET-4
- 联系方式:电话 [17344338724] / 邮箱 [imjiaoyuan@gmail.com]
- 内容输出:公众号 [猫四叔/1.1k 粉丝] / 博客 [yuanj.top]
- GitHub:github.com/imjiaoyuan
个人技能
- 熟悉命令行环境且能够编写 Shell 脚本与 R / Python 代码进行 NGS 数据分析流程与基因家族分析
- 熟悉 BLAST / hmmer / AlphaFold / IGV / NCBI / InterPro 等常用生物信息学工具与数据库
- 能够进行 Gromacs 分子动力学模拟的常规流程
项目经历
- 2022.12-2023.09 Sus scrofa 基因组的 RNA-seq 数据分析与 ACSL 基因家族分析:独立完成 RNA-seq 数据分析、分析 ACSL 基因家族的功能与表达模式
- 2022.12-2023.09 黑麦草重金属胁迫响应基因的筛选与生物信息学分析:2023 年生命科学竞赛、项目负责人、负责 RNA-seq 数据分析与基因家族分析
- 2022.10-2023.12 预测β-1,4-内切木聚糖酶的柔性位点:使用 Gromacs 分子动力学模拟预测了β-1,4-内切木聚糖酶的柔性位点,为后续的酶工程改造提供依据
- 2022.12-2023.09 红色研学旅行网站:2023 年三创赛省级二等奖、第二负责人、负责项目网站搭建
- 2022.12-2023.09 过表达 OsSGL2 基因对植物高温胁迫抗性的影响:2022 年生命科学竞赛国家级二等奖、负责基因家族分析与部分论文内容撰写
- 2022.12-2023.09 成都理工大学黄进课题组成员:协助课题组完成植物抵抗逆境胁迫相关课题并参与 4 篇论文撰写、搭建并运营原课题组官网、通过 RNA-seq 等生信分析协助课题组开展新课题
- 2022.10-2023.05 珙县苗族蜡染文化现状分析与发展前景调研:2023 年市场调查分析大赛国家级三等奖、负责调研数据分析和论文图表绘制
学术论文
- 贾雁茹,靳雨璠,焦元,等 . 植物青素 Phytocyanin 蛋白家族研究进展综述 [J]. 植物科学学报,2024
- 江珊,吴龙英,赵宝生,黄佳惠,蒋宇喆,焦元,黄进 . 植物耐受高温胁迫的分子机制研究进展 [J]. 中国农学通报,2024, 40(9): 132-138.
- Wu L, Wang R, Li M, Du Z, Jin Y, Shi Y, Jiang W, Chen J, Jiao Y, Hu B, Huang J. Functional analysis of a rice 12-oxo-phytodienoic acid reductase gene (OsOPR1) involved in Cd stress tolerance. Mol Biol Rep. 2024 Jan 25;51(1):198.
- Tong J, Wu L, Li B, Jiang N, Huang J, Wu D, Zhou L, Yang Q, Jiao Y, Chen J, Zhao K, Pei X. Image-based vegetation analysis of desertified area by using a combination of ImageJ and Photoshop software. Environ Monit Assess. 2024 Feb 26;196(3):306.