最新版 HMMER 查找同源基因

pfam 数据库更新了，原有的下载 hmm 模型与种子文件的方法需要进行一些改变。

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pfam 官网已经通知，将数据迁移到 interpro 了，所以之前下载 hmm 模型的方法已经不适应了，需要进行一些改变。

打开 interpro 网站，首页往下翻，找到 pfam

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搜索结构域

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进入结构域的详情页面，点击左栏的 Alignment，选择 seed 然后下载种子文件，下载后是一个压缩包，解压后是 SEED.ann 文件，与之前旧版数据库里的 PFseed_xxxx.txt 是一样的。

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接着再点击左栏的 Curation，下载 hmm 模型文件。

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之后的 HMMER 的使用就和之前一样，没什么变化了。