谈谈一些日常

不知道什么时候起,越来越反感墙内的社交网站了,当然,墙外的我上的也不多,但总体感觉上就是氛围和体验要比墙内的好一些。

Gromacs 分子动力学模拟

近期做了一次分子动力学模拟实验,命令比较多,整理一下步骤,参考了生信实战的教程,但他们的教程存在很多问题,这里完善一下。

那些年我们玩过的游戏

今天晚上去跟朋友打篮球,路上不知怎么的,就聊到了游戏上面,回忆了一下从小到大玩过的这些游戏,不禁感叹时光飞逝~

胡思乱想

今天看到三体第一部,罗辑深爱上自己为给白蓉完成生日礼物而想象出来的爱人,似乎到了一种他无法自拔的地步,于是他去看了心理医生,医生说:“大部分人的爱情对象也只是存在于自己的想象之中 。他们所爱的并不是现实中的她 (他 ) ,而只是想象中的她 (他 ) ,现实中的她 (他 )只是他们创造梦中情人的一个模板 ,他们迟早会发现梦中情人与模板之间的差异 ,如果适应这种差异他们就会走到一起 ,无法适应就分开 ,就这么简单 。你与大多数人的区别在于 :你不需要模板 。”

十月失眠

今天从早上起来开始,眼睛就一直很痛,我猜测可能是前一天晚上没有睡好,最近老是失眠,于是上完课,做完黄老师让我讲解的黑麦草 HIPP 基因家族鉴定的 PPT 之后,就立马躺下睡觉了,但是一直睡不着 …

做了一个 presentasion 后的总结

今天给农科院基因组研究所的黄三文老师发了邮件和简历,没想到才没过多久就有一位黄老师的博士生加我微信,说是要我做一个 presentasion,了解一下我,也跟我讲了讲黄老师课题组的一些事情。

使用 HMMER 网页工具进行结构域分析

由于数据库之间的差异,使用 NCBI CDD Search 搜索结构域有时候并不能满足我们的需要,比如我们通常使用 HMMER 来鉴定同一家族的基因并且需要进行结构域可视化,但 HMMER 所使用的数据都来自 pfam,它的数据库可能与 NCBI 的不同,因此而造成结果上的差异。